A un lado del altar mayor está ubicada la Capilla de la Piedad. De estilo renacentista, está considerada artísticamente como el conjunto funerario más rico del País Vasco.El retablo casillero de estilo plateresco (1533-1536), La traza fue diseñada por el arquitecto vallisoletano Gaspar de Tordesillas y fueron los entalladores Juan de Olazaran, Andrés de Mendiguren, Miguel de Iragorri y el imaginero vitoriano Juan de Ayala. A la derecha en un pedestal en lo alto podemos ver el sarcofago del Obispo Rodrigo Mercado de Zuazola, hijo de la villa, que auspizió la construccion como su ultima morada.